Es un software de gestión empresarial creada con el fin de administrar la información hospitalaria, que brinda una solución muy versátil y adaptable a las necesidades de gestión y manejo de información en centros de salud, consultorios grandes y pequeños. Con GNU Health es posible administrar un sistema de información con todo lo relacionado a la salud, puesto que proporciona las funcionalidades de registro médico electrónico (EMR), gestión hospitalaria (HMIS) y sistema de información de salud (HIS).
GNU Health consta de una estructura modular, en donde cada módulo es independiente, lo que permite gestionarlos de acuerdo los requerimientos de cada hospital o consultorio.